『课程目录』:
├─16S rRNA测序分析
│ 16s分析1QIIME 安装及linux命令.mp4
│ 16s分析2OTU注释及venn图-heatmap图.mp4# B1 z# H0 H" [3 b+ |& s* \4 [" V, U
│ 16s分析3Alpha 和Beta多样性.mp4
│ 16s分析4系统树构建和可视化.mp4
│ 16s测序.rar
│ 9 x9 `. |- M! x0 ~! a/ v% s; w4 ]" h' q
├─宏基因组专题生信分析4 D- d' W6 J9 c7 W- G: o
│ │ 章节1课时1宏基因组软件安装.mp4
│ │ 章节2课时2linux简介与实操(上).mp4
│ │ 章节2课时3linux简介与实操(下).mp4
│ │ 章节3课时4linux下宏基因组软件安装.mp4
│ │ 章节4课时5R简介和统计绘图.mp4: r" |( `& q5 l8 O* j7 l
│ │ 章节5课时6宏基因组常用图形绘制和解读.mp4
│ │ 章节6课时7AI论文图表修改排版.mp4
│ │ 章节7课时8宏基因组简介.mp4) d+ B3 G' P: y
│ │ 章节8课时9宏基因组质控.mp4
│ │ 章节9课时10宏基因组物种和功能组成.mp4. o- B$ b9 o, X+ E/ u; M
│ │ 章节10课时11宏基因组物种和功能组成可视化.mp4
│ │ 章节11课时12宏基因组共存网络分析.mp4+ F q' r! l+ V9 I3 u: }8 J
│ │ 章节12课时13宏基因组cytoscape绘制菌群共存网络图(上).mp4
│ │ 章节12课时14宏基因组cytoscape绘制菌群共存网络图(下).mp45 G# c7 J! k: T9 M! B0 q
│ │ 章节13课时15测序序列无参物种注释Kraken2.mp4
│ │ 章节14课时16宏基因组无参拼接.mp4
│ │ 章节15课时17宏基因组功能注释数据库.mp4
│ │ 章节16课时18Binning宏基因组分箱.mp4. {; Z9 C- e& i4 G: A, o
│ │ 章节17课时19宏基因组和多基因系统树构建与美化.mp4( g! v! Z1 ? `! n/ P
│ │ 章节18课时20宏基因组内容串讲.mp4
│
├─易生信python基础培训
│ Python基础语法巩固.mp4) @+ ^, m5 w3 I
│ Python基础语法简介1.mp4
│ Python基础语法简介2.mp4
│ Python基础语法简介3 .mp4# W; p6 @) l$ I3 `
│ python实战练习1.mp4
│ python实战练习2.mp4
│ python实战练习3.mp4
│ python实战练习4.mp41 Q) W5 b7 c1 }' \) t
│ python实战练习5.mp4
│ python实战练习6.mp4
│ Python案例 (ID转换、统计染色体基因数目、外显子长度).mp4
│ python深度学习.mp4
│ 小工具介绍.mp4
│ 补充视频.mp4" t$ ?+ O3 R7 W2 ?" n! e0 R
│
├─转录组数据分析. f* m5 O" \ u9 | y9 Y, C! [
│ ├─01、转录组基础
│ │ 01、转录组基础(上).mp4
│ │ 02、转录组基础(下).mp4
│ │ 11-转录组概述(1).pdf
│ │ 11-转录组概述.pdf– H( |8 ?2 W, B
│ │
│ ├─02、Windows下转录组分析软件的安装
│ │ 01、Windows下转录组分析软件安装.mp4: ^; n: G+ [$ B/ Z* V' ~( W# K
│ │ 02、Windows软件安装-510.mp4
│ │ 转录组数据分析软件安装-Windows.zip D; I6 \; O m1 \5 J$ s
│ │ 0 l* h0 R+ E. B" x$ ^" S; R
│ ├─03、Linux下的软件安装和一键配置转录组运行环境5 [8 Y4 [; N" D4 f: c5 |' b- V
│ │ 01、Linux下软件安装和一键配置转录组运行环境.mp4
│ │ 02、Linux下软件安装-510.mp4
│ │ 13-1-转录组软件安装-Linux(1).pdf+ v- T0 C: R5 ]& h7 A8 W
│ │ 13-1-转录组软件安装-Linux.pdf1 _# l' D7 t6 I5 F7 C& v; \
│ │
│ ├─04、转录组Salmon分析流程讲解0 ^# T$ C9 T: Y* z) N
│ │ 01、Salmon基础.mp4; |8 R f6 Q7 F1 l
│ │ 02、Salmon实战操作.mp4) P' P& P* L. N' b
│ │ 03、Salmon理论-510.mp4
│ │ 04、Salmon实战-510.mp4
│ │ 12-转录组分析流程Salmon(1).pdf
│ │ 12-转录组分析流程Salmon.pdf* }8 _' U4 Z8 ` ~$ O' {% x
│ │ 13salmondeseq2go.zip4 H& f0 t0 c4 \+ Y- Y: c
│ │ transcriptomeserver.zip4 m E ]+ ]9 f6 o
│ │ 2 G- v5 N0 E& A" A
│ ├─05、DESeq2差异基因分析理论和操作! d9 o( G% |: {% M
│ │ 01、DESeq2差异基因分析理论和操作1.mp4, h+ z8 ?9 k; Q7 Y- I
│ │ 02、DESeq2理论-510.mp46 h8 J Y/ A2 h9 ~/ G
│ │ 03、DESeq2差异基因分析理论和操作2.mp4" ]' ^4 @; X, V2 _. ? L/ o+ |
│ │ 04、DESeq2实战-510.mp4; ~* I; ^- s1 v* j
│ │ 14-差异基因分析理论和实战(1).pdf6 o, M' m5 m2 c4 o" o
│ │ 14-差异基因分析理论和实战.pdf
│ │ 2 ?6 |, I' L; }) i$ F! }9 j
│ ├─06、GO、KEGG富集分析理论和可视化讲解6 a+ D1 K+ |' ]& q b* M. L
│ │ 01、GO KEGG富集分析理论和可视化讲解.mp4
│ │ 02、GO KEGG msigdb富集分析和可视化实战.mp45 v8 v7 }6 ^5 l8 v# G
│ │ 03、GO富集理论-510.mp43 ]! F4 ?9 e' |$ C
│ │ 04、GO富集操作+CytoscapeclueGO-510.mp4
│ │ 1516-GOGSEA富集分析原理和操作(1).pdf6 o9 m: ?" \, u" ~) ^: Y
│ │ 1516-GOGSEA富集分析原理和操作.pdf
│ │ goeast.txt5 C6 r* o1 f+ {8 R) }' {
│ │ 9 z2 H1 O M1 g( f
│ ├─07、利用Cytoscape-clueGO进行富集分析9 {3 o$ ^( Y0 B: p+ l* d+ h$ j
│ │ 01、Cytoscape富集可视化Pathway通路映射.mp4' x3 v6 O7 ~/ \/ z$ K& I
│ │ 02、Cytoscape clueGO进行富集分析和网络可视化.mp4
│ │ 03、Cytoscape理论和pathway-510.mp4
│ │ 25-Cytoscape绘制网路通路图(1).pdf/ K( C' }& c# o8 Y9 j+ d
│ │ 25-Cytoscape绘制网路通路图.pdf9 O& c: L# [' N6 `, l% Q- m
│ │ cytoscape演示数据.zip
│ │ KEGG.zip– x% ?* A, ~* [: a: W
│ │ 7 M1 |$ N( x0 J* _; {' y
│ ├─08、GSEA富集分析理论和可视化案例讲解1 y. m0 W. Y8 b7 V7 I5 s1 O
│ │ 01、GSEA富集分析理论和可视化案例讲解(GO、KEGG、MsigDB).mp4* b; j/ ^. L e) }
│ │ 02、GSEA两组样品和时间序列富集分析.mp4. a: G0 P1 a/ t" J0 d5 O
│ │ 03、GSEA理论-510.mp4
│ │ 04、GSEA实战-510.mp4) L) X5 Y( S1 `
│ │ 15GSEA.zip: l0 P8 z7 [# V: L* }) J- C
│ │
│ ├─09、二代和三代高通量测序原理
│ │ 01、二代和三代高通量测序原理.mp45 c' e+ H9 L: a# t9 @* Q$ F
│ │ 02、中心法则测序应用-510.mp4
│ │ 03、测序原理-510.mp4
│ │ 21-二代测序平台和原理(1).pdf
│ │ 21-二代测序平台和原理.pdf
│ │
│ ├─10、转录组STAR比对分析流程讲解
│ │ 01、转录组STAR比对分析流程讲解.mp4* b" I7 T. n3 Q4 \# X. Q
│ │ 02、STAR有参操作解释-510.mp4
│ │ 03、STAR有参操作总结-510.mp4
│ │ 22-转录分析流程STAR(1).pdf2 p' \2 B3 E5 O
│ │ 22-转录分析流程STAR.pdf5 h( ^) H( }7 o5 U
│ │
│ ├─11、转录组STAR比对分析实战与IGV可视化、比对评估、饱和性检测
│ │ 01、转录组STAR比对分析实战和IGV可视化 比对评估 饱和性检测.mp4, \, v1 ^. o9 F/ n2 ?
│ │ 02、IGV可视化-510.mp4
│ │ 23-转录组分析流程-IGV(1).pdf
│ │ 23-转录组分析流程-IGV.pdf
│ │ / P' j8 X. B5 m+ L
│ ├─12、STAR定量结果差异基因分析和与Salmon结果比较; j' }3 p$ r* Y' l
│ │ 01、STAR定量结果差异基因分析和与salmon结果比较.mp4( Q# J: r* _* u
│ │ 23stardeseq2go.zip
│ │ 6 _4 v3 h7 v1 N ^, U5 t) U
│ ├─13、WGCNA理论分析和注意事项、案例解读
│ │ 01、WGCNA理论-510.mp4
│ │ 02、WGCNA理论分析和注意事项、案例解读.mp4% F. ~: x- l* `" S. Z+ w
│ │ 24-WGCNA共表达网络分析(1).pdf
│ │ 24-WGCNA共表达网络分析.pdf* X" k* J7 w0 |, j- X
│ │ / P+ j3 `6 {) U. Y0 y
│ ├─14、WGCNA共表达实战
│ │ 01、WGCNA实战和网络可视化-510.mp4
│ │ 02、WGCNA共表达实战.mp49 f9 C% f8 s0 m/ @; T( C0 u
│ │ 24WGCNA.zip
│ │
│ ├─15、转录组组装和可变剪接分析理论和实战
│ │ 01、转录组组装和可变剪接分析理论和实战.mp4, G7 j ~- v, \; s% q7 O. _+ b
│ │ 31-转录本拼装和可变剪接.pdf
│ │ # e: @# D7 h# f
│ ├─16、无参转录组分析理论( o9 I& T) n. f1 O. m6 @# E
│ │ 01、无参转录组分析理论.mp48 a# B q# X$ {; ?$ s: O
│ │ 32-无参转录组组装和注释.pdf6 g+ n: I& J- ]% J. P! ?7 W) G
│ │ 6 N; c4 a& v2 f+ ^& L
│ ├─17、单细胞转录组概念
│ │ 01、单细胞转录组概念.mp4
│ │ 31-单细胞转录组基本概念.pdf+ R$ }6 l3 @/ d/ R# c& ?, P! D
│ │
│ ├─18、单细胞转录组实战
│ │ 01、10X拆库浏览.mp4 b r5 ]3 G% \9 C3 Y
│ │ 02、单细胞转录组数据获取-510.mp4: [1 X+ r0 T. j* r$ k4 r
│ │ 03、seurat-monocle-scater包解释和运行.mp4/ \% L1 `8 h" B6 d! ]: g) n
│ │ 32-单细胞转录组实战.pdf
│ │ 33-单细胞转录组数据获取.pdf
│ │
│ ├─19、PCA、TSNE、单细胞理论和操作3 N" n0 z( ~4 L% p }" G
│ │ 01、PCA TSNE理论.mp42 ~2 o& w1 j6 ^7 H7 e3 o
│ │ 02、PCA TSNE单细胞操作.mp4" A8 q: |- z9 v! B- g6 {
│ │ 34-PCA和单细胞可视化.pdf
│ │ PCAscRNA.zip
│ │ . i6 ?* n8 G" u6 U6 ?
│ ├─20、常用转录组资源数据库简介
│ │ 01、常用转录组资源数据库简介.mp4
│ │ 33-转录组案例分析和基因表达资源数据库.pdf
│ │ + p6 ]& i' }8 u( J7 l
│ ├─21、常见图形解读
│ │ 01、常见图形解读.mp4
│ │ 02、常见图形解释-510.mp4
│ │ 26-转录组常用图形解读(1).pdf: `2 r0 J; m9 X! M* l `
│ │ 26-转录组常用图形解读.pdf
│ │
│ ├─22、AdobeIllustrator修图和拼图
│ │ 01、AdobeIllustrator修图和拼图.mp4
│ │ 36AI.zip2 E t9 s' a3 U! h! a! |- ]
│ │ 36论文图表.pdf) g7 C6 J8 `8 N3 w8 f+ X& k
│ │
│ ├─23、Linux基础(一)晚间额外课– y+ J Z' P: I7 D& Y4 ?' ^9 r( q
│ │ 01、Linux基础 (一)晚间额外课.mp49 N" `3 N. {) v
│ │ Linux基础.zip
│ │ linux简介与实操.pdf/ H9 e. H5 B8 R$ {' e, |
│ │ ' L7 Q8 U# D, s- c1 U, M: ^' x
│ ├─24、Linux基础(二)晚间额外课
│ │ 01、Linux基础(二)晚间额外课.mp41 d+ L7 ?4 u. g6 K, O
│ │ " x' B$ c' `( M& \
│ ├─25、Excel便捷操作( H! Q5 j2 f( O" o* S0 y
│ │ 01、excel操作-510.mp4
│ │ Excel.190511.pptx( z0 ]1 A4 U- U) B: J6 p
│ │
│ ├─26、发表文章相关知识, h8 P/ e! {0 U6 V: E, h5 l# y& `1 g
│ │ 01、发表文章-510.mp4
│ │ 35发表前准备.pdf
│ │ * T+ H% W7 v4 _. u' m' c+ R9 f
│ └─27、两周后的答疑9 n# G' [" u5 w% f% K& m
│ 01、两周后的答疑.mp4
│
└─转录组(单细胞转录组)教程6 a3 W0 @% I6 u6 n
│ 课时1转录组概述.mp4
│ 课时2生信老司机以中心法则为主线讲解组学技术的应用和生信分析心得.mp43 l3 ]! B7 A2 X2 ?' q% ~0 A) o
│ 课时3总安装概论.mp41 }) l G3 B [; S
│ 课时4Linux下软件安装(1).mp46 T% L- m( S/ u6 u+ C
│ 课时5Linux下软件安装(2).mp4$ X, ]0 w8 y: [( y
│ 课时6Windows下软件安装.mp4
│ 课时7基于Salmon的转录组分析流程理论.mp44 p, Y. n8 F% c/ }( {+ c9 X
│ 课时8基于Salmon的转录组分析流程实战.mp4
│ 课时9Salmon+DESeq2差异基因分析理论.mp4
│ 课时10Salmon+DESeq2差异基因分析实战(简化版).mp4
│ 课时11Salmon+DESeq2差异基因分析实战(代码解释).mp4
│ 课时12GO富集分析理论(一).mp4
│ 课时13GO富集分析理论(二).mp47 ?% Y1 D4 l' `0 s
│ 课时14GO富集分析理论实战(一).mp4
│ 课时15GO富集分析实战(二,详细版).mp4
│ 课时16GO富集分析ClueGO实战和可视化.mp4
│ 课时17GSEA富集分析理论.mp4
│ 课时18GSEA富集分析理论和实战(加录).mp4
│ 课时19GSEA富集分析实战.mp4
│ 课时20GSEA富集分析实战(二).mp4% L1 i7 B( E, j. ~6 v- S
│ 课时21Linux基础理论和操作.mp4
│ 课时22二代和三代测序原理.mp4 L; [; P+ b. v' h; E
│ 课时23STAR转录组分析流程理论.mp4, a- k6 Q4 b0 K# `$ S
│ 课时24STAR转录组分析流程实战和IGV可视化.mp4
│ 课时25STAR转录组分析流程实战和差异基因分析.mp4( {5 D! b, U2 u7 U; i
│ 课时26WGCNA加权共表达网络分析.mp4
│ 课时27WGCNA加权共表达网络分析简化操作.mp4. g; n8 K# v$ [2 }
│ 课时28WGCNA加权共表达网络分析分步操作.mp4" q5 d! `0 R. X1 B- Y9 R6 g1 l
│ 课时29Cytoscape理论和操作.mp4
│ 课时30Cytoscape可视化KEGG通路和WGCNA网络.mp4: g3 @6 _- N2 ~
│ 课时31转录组常见图形解读(1).mp49 i( V6 _1 w2 S- S. D" A& |
│ 课时32转录组常见图形解读(2).mp4
│ 课时33R基础介绍.mp49 k* I2 ?6 X" f* _0 C
│ 课时34选择性剪接理论和操作(rMATS).mp44 p, ^8 U$ E- q
│ 课时35无参转录组分析概述.mp4, X6 F. o: A7 Y% p1 Q
│ 课时36单细胞转录组基本概念、原理和技术评估.mp4
│ 课时37单细胞转录组Cellranger 3.0分析流程和实战.mp4
│ 课时38单细胞转录组实战Seurat完成细胞分型.mp4
│ 课时39PCA分析和tSNE分型再探1.mp4
│ 课时40PCA分析和tSNE分型再探2.mp4$ P0 \ r% O7 o; P- ?3 ?) }9 v, E
│ 课时41单细胞转录组细胞周期鉴定和Monocle发育轨迹.mp4/ o4 {5 @4 [: I
│ 课时42AI修图和拼图1.mp4
│ 课时43AI修图和拼图2.mp4
│ 课时44AI绘制模式图.mp4
原文链接:易博士课堂,转载请注明出处。
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